refactor: 重构项目结构，将geo_tools重命名为app并更新相关引用

- 将主包名从geo_tools改为app
- 更新所有模块中的引用路径
- 迁移并更新测试用例
- 添加项目规则文档
- 保持原有功能不变，仅进行结构调整

.trae/rules/project_rules.md

@@ -0,0 +1,8 @@
+# 给 AI 助手看的规则 - 小白专用版
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+## 关于内存（最重要）
+1. 凡是读文件的函数，只要没加 `rows` 限制或 `chunk_size` 分块，都要在注释里用【警告】两个字提醒用户注意内存风险。
+2. 不要用 `for` 循环一行行修改 GeoDataFrame，要用 `apply` 或者向量化操作。
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+## 关于报错
+3. 禁止直接把底层库（fiona, shapely）的英文报错抛给用户看。必须包一层 try-except，翻译成中文提示，例如：“文件打不开，检查一下路径是不是有中文？”或者“数据里有烂掉的图形，已自动修复/跳过”。